ב-20 לאפריל 2017, ארגון הסיינטולוגיה של מקדוניה הוכר רשמית כארגון דתי. בית-המשפט המחוזי של סקופיה II פסק שכל הדרישות המשפטיות המוקדמות מולאו, בהתאם לחוק על המעמד החוקי של ארגון דתיים, קהילות דתיות וקבוצות דתיות ברשומות של רפובליקת מקדוניה.

"מסקירה יסודית של הראיות, בית-המשפט החליט כי למייסדים ולאדם שמוסמכים לייצג את ההתאגדות מרצון של ישויות יש אזרחות חוקית וכי אותם אנשים ממלאים באופן מלא את דרישות המקדימות שרשומות בסעיפים 11 ו-12 של החוק על המעמד החוקי של ארגונים דתיים, קהילות דתיות וקבוצות דתיות כדי להיות רשומים ברישום של ארגונים דתיים, קהילות וקבוצות דתיות בתור ארגון דתי, תחת השם: ארגון הסיינטולוגיה של מקדוניה".